УВКБ ООН открыло свое представительство в Таджикистане в 1993 году после получения приглашения от Правительства страны оказать чрезвычайную помощь людям, перемещенным внутри страны в результате гражданской войны.
В 1993 году Республика Таджикистан первой в Центральной Азии присоединилась к Конвенции о статусе беженцев 1951 года и Протоколу, касающемуся статуса беженцев, 1967 года. С тех пор УВКБ ООН работает с Правительством над созданием надежной системы предоставления убежища и оказывает защиту и помощь беженцам.
В настоящий момент в Республике Таджикистан насчитывается самое большое в Центральной Азии количество беженцев, в основном, из соседнего Афганистана. В стране действует национальный закон «О беженцах», и Правительство осуществляет процедуру по определению статуса беженца (RSD). УВКБ ООН продолжает работать с Правительством над тем, чтобы обеспечить соответствие нормативно-правовой базы международным стандартам при оказании поддержки беженцам для их интеграции в местное сообщество. Больше значение уделяется помощи с получением средств к существованию, чтобы беженцы могли стать независимыми и вносить свой вклад в общество.
В соответствии с мандатом о безгражданстве УВКБ ООН работает с Правительством Таджикистана над предотвращением и сокращением безгражданства. Проблема безгражданства в Таджикистане, как и во многих центральноазиатских странах, является результатом развала Советского Союза, миграции, в том числе из-за гражданской войны и смешанных браков, пробелов в национальном законодательстве и практике или административных препятствий, которые мешают получению или подтверждению гражданства.
УВКБ ООН работает с Правительством, агентствами ООН, международными организациями и негосударственными организациями в Таджикистане по планированию готовности к чрезвычайным ситуациям в рамках Межучрежденческой рабочей группы по положению в Афганистане.