УВКБ ООН в России осуществляет разнообразную деятельность, направленную на борьбу с проявлениями ксенофобии, продвигает идеи толерантности в отношении беженцев и других категорий лиц, находящихся в ведении Агентства посредством проведения мероприятий по информированию и просвещению общественности, включая работу «горячей линии», поддержку радиопередачи о проблемах беженцев и миграции, проведение конкурсов и выставок, посвященных Всемирному дню беженцев и другим памятным датам. УВКБ ООН принимает участие в международных кинофестивалях фильмов о правах человека, и проводит семинары для журналистов, освещающих проблемы миграции и перемещения.
УВКБ ООН в России ежегодно проводит мероприятия, посвященные Всемирному дню беженцев, в том числе круглые столы с представителями министерств и ведомств, в компетенции которых находятся вопросы миграционной политики, благотворительных организаций, заинтересованной общественности; фотовыставки, презентации, благотворительные акции. Беженцы и лица, ищущие убежище в России, принимают активное участие в перечисленных мероприятиях.
УВКБ ООН оказывает поддержку международному фестивалю фильмов о правах человека «Сталкер». С 2001 года УВКБ ООН ежегодно вручает приз «За отражение темы защиты прав беженцев в кинематографе».
Под патронажем УВКБ ООН функционируют рабочие группы по толерантности и по социальным вопросам. Рабочие группы – это сеть взаимодействия организаций-единомышленников, имеющих аналогичное видение и подходы к методам противодействия ксенофобии и воспитания толерантности к беженцам и иным категориям мигрантов, и готовых объединить усилия по оказанию социальной и психологической помощи наименее защищенным категориям беженцев и иным лицам в ведении Агентства. В составе рабочих групп – представители российских правозащитных НПО и исследовательских центров, изучающих проблемы ксенофобии и расовых преступлений, НПО, работающих с беженцами и мигрантами на уровне сообщества и способствующих их интеграции , СМИ и международных организаций.