レズビアン・ゲイ・バイセクシャル・トランスジェンダー（LGBT）の人びとに対する差別にインドネシア政府当局が加担し、HIVの流行を加速させている。警察やイスラム過激派が私的なLGBTの集まりに対し、恣意的かつ不法な踏込み捜査を行っているにもかかわらず、政府はこれを止めないでいる。これにより、弱い立場にある人びとのための公衆衛生およびアウトリーチの取組みが事実上とん挫してしまっている。