تعقد المفوضية منذ أكثر من ربع قرن مشاورات سنوية مع شركائها من المنظمات غير الحكومية. وقد تطور اللقاء في جنيف من اجتماع ليوم واحد، تحضّر خلاله المنظمات غير الحكومية مداخلاتها للاجتماع السنوي للجنة التنفيذية التي تتولى إدارة المفوضية، إلى ثلاثة أيام من التحاور بشأن مجموعة واسعة من المواضيع التي تهمّ كلاً من المنظمات غير الحكومية والمفوضية.

تتوسع هذه المشاورات من سنة لأخرى، حتى بات يحضرها أكثر من 350 ممثلاً وحوالي 200 منظمة من كافة أنحاء العالم، ويشارك فيها ممثلون عن منظمات صغيرة وكبيرة، وطنية ودولية، تعنى بتقديم المساعدة وحشد التأييد (بما فيها تلك المتخصصة في إعادة التوطين). كما تشارك في المشاورات وكالات الأمم المتحدة الشقيقة.

وتؤمن هذه المشاورات منبراً مهماً تتمكن المنظمات غير الحكومية من خلاله طرح القضايا والتواصل وإنشاء الشبكات وتبادل وجهات النظر مع المفوضية. ومن المواضيع النموذجية التي تطرح عادة للنقاش: حقوق الإنسان واللاجئون في المناطق الحضرية وتقلّص الحيز الانساني وقانون اللاجئين وتعليم ما بعد المرحلة الابتدائية للمراهقين والشباب والأشخاص النازحون داخلياً وحماية النساء والأطفال المعرضين للخطر وقضايا إقليمية ورصد اللاجئين وملتمسي اللجوء والمهاجرين المحتجزين.